SARS-CoV
严重急性呼吸综合症相关冠状病毒(SARSr-CoV)是冠状病毒的一种,属于β冠状病毒属和亚属Sarbecoronavirus。SARSr-CoV是一种包膜的正义链单链RNA病毒,通过结合ACE2受体进入其宿主细胞,然后感染人类、蝙蝠和某些其他哺乳动物。[1] 蝙蝠是许多SARS相关冠状病毒的重要宿主。只有最近SARS相关冠状病毒株才演化并跨越从蝙蝠到人类的物种间传播,比如SARS-CoV和SARS-CoV-2株。[2]
SARS-CoV和SARS-CoV-2在人类中引发了严重呼吸道疾病的爆发:SARS-CoV(或SARS-CoV-1),它在2002年至2003年之间引发了严重急性呼吸综合症(SARS)的爆发,以及SARS-CoV-2,它引发了2019-20冠状病毒病(COVID-19)的大流行。
在本文中,我们主要讨论SARS-CoV,包括结构、重要蛋白质、感染机制、感染症状、传播、诊断和治疗。
SARS-CoV的结构
SARS相关冠状病毒是一种包膜的正义链单链RNA病毒。其基因组约为30 kb,是RNA病毒中最大的之一。
病毒包膜由一个脂双层组成,膜(M)、包膜(E)和突刺(S)蛋白被固定在其中。[3] 突刺蛋白与其相应的宿主细胞受体的相互作用在决定病毒的组织定向性、传染性和物种范围方面起着关键作用。[4] 在包膜内,有核衣壳,由多份核衣壳(N)蛋白形成。脂双层包膜、膜蛋白和核衣壳在病毒离开宿主时保护其免受损害。[5]
遵循冠状病毒亚科的复制策略,SRAS-CoV的主要人类受体是血管紧张素转化酶2(ACE2),这是在2003年首次发现的。[6]
图1. sars冠状病毒的结构
SARS冠状病毒蛋白
靶点 | Uniprot No. | 蛋白名称 | 说明 |
---|---|---|---|
1a | P0C6U8 | Replicase polyprotein 1a | 木瓜蛋白酶样蛋白酶(PL-PRO)负责位于复制酶多蛋白n端的切割。 |
3a | P59632 | Protein 3a | 形成同四聚体钾敏感离子通道,可调节病毒释放。上调宿主肺上皮细胞纤维蛋白原亚基FGA、FGB和FGG的表达。 |
3b | P59633 | Non-structural protein 3b | 诱导宿主细胞G0/G1阻滞和凋亡 |
6 | P59634 | Non-structural protein 6 | 可能是病毒毒性的决定因素 |
7a | P59635 | Protein 7a | 细胞培养中病毒复制所必需的非结构蛋白 |
7b | Q7TFA1 | Protein non-structural 7b (E.coli) | |
8a | Q7TFA0 | Protein non-structural 8a | |
8b | Q80H93 | Non-structural protein 8b | |
9b | P59636 | Protein 9b | 编码这种蛋白质的基因包含在N基因中 |
E | P59637 | Envelope small membrane protein | 在病毒形态发生和组装中起核心作用 |
M | P59596 | Membrane protein | 病毒包膜的一个组成部分,通过与其他病毒蛋白的相互作用在病毒的形态发生和组装中起核心作用。 |
N | P59595 | Nucleoprotein (N) (E.coli) Nucleoprotein (N) (Baculovirus) |
将病毒基因组正链RNA包装成螺旋状核糖核衣壳,通过与病毒基因组和膜蛋白M的相互作用,在病毒粒子组装过程中发挥基础性作用。 |
ORF14 | Q7TLC7 | Uncharacterized protein 14 | / |
rep | P0C6X7 | Replicase polyprotein 1ab | 参与病毒rna转录和复制的多功能蛋白。含有负责多蛋白裂解的蛋白酶。 |
S | P59594 | Spike glycoprotein(S) (Yeast) Spike glycoprotein(S) (Active) (Mammalian cell) |
通过与宿主受体相互作用,将病毒粒子附着在细胞膜上,引发感染。 |
N/A | C8YZ74 | 3C-like proteinase (in vitro E.coli expression system) | / |
由SARS-CoV引起的疾病
严重急性呼吸综合症(ARS)是由SARS-CoV引起的疾病。这种疾病通常以高烧开始,有时伴随寒战或其他症状,包括头痛、全身不适和肌肉疼痛。一些人初始阶段也可能出现轻微的呼吸道症状。大约10% - 20%的患者还会出现腹泻。2-7天后,SARS患者可能会出现干咳、无 class="margin-big-top"痰咳嗽,并可能伴有或发展到血液中氧含量低的情况。在10% - 20%的病例中,患者需要机械通气。大多数患者会发展成肺炎。
在2003年的SARS爆发中,约有9%的确认感染SARS-CoV的患者死亡。[7] 对于那些60岁以上的人,死亡率要高得多,该人群的死亡率接近50%。
SARS-CoV传播
SARS-CoV主要通过人与人之间的传播途径传播。
人们普遍认为,SARS-CoV最容易通过被感染者咳嗽或打喷嚏时产生的飞沫传播。飞沫传播发生在被感染者的咳嗽或打喷嚏产生的飞沫被短距离抛射到空气中,并沉积在附近人的口腔、鼻子或眼睛的粘膜上的情况下。
此外,当一个人触摸被感染飞沫污染的表面或物体,然后触摸他或她的口腔、鼻子或眼睛时,病毒也可以传播。
此外,SARS-CoV可能通过空气或其他目前未知的方式更广泛地传播。
SARS-CoV疾病的诊断
SARS-CoV疾病的诊断和控制措施应基于暴露的风险。
在全球范围内没有人际传播SARS-CoV的情况下,只有在需要因放射学确认的肺炎而住院治疗,并且有引起SARS-CoV疾病怀疑的流行病学史的患者中才应考虑SARS-CoV疾病的诊断。
一旦在全球范围内已经证实了SARS-CoV的人际传播,仍应考虑需要因肺炎而住院治疗,并且有上述流行病学史的患者中是否有SARS-CoV疾病的诊断。此外,所有发热或下呼吸道症状患者应被问及在症状开始后10天内是否与疑似患有SARS-CoV疾病的人密切接触过,或是否有到已证实或疑似有SARS-CoV的地点的外出历史,或是否与有这种暴露史的患者有密切接触。
用于SARS-CoV的可用实验室检测包括使用酶免疫测定法(EIA)进行抗体检测,以及用于呼吸道、血液和粪便标本的逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)测试。在怀疑有SARS-CoV的患者中,初始的诊断评估应根据临床需要进行,可能包括:
- 胸部X射线检查
- 脉搏血氧饱和度测量
- 全血计数及分类计数
- 血培养
- 痰液革兰氏染色和培养
- 病毒性呼吸道病原体的检测,尤其是甲型和乙型流感病毒以及呼吸道合胞病毒
- 用于检测痕虫病和肺炎链球菌的尿抗原测试的标本
参考文献:
[1] Wong AC, Li X, Lau SK, et al. Global Epidemiology of Bat Coronaviruses [J]. Viruses. 2019 Feb; 11(2): 174.
[2] Cui J, Han N, Streicker D, Li G, et al. Evolutionary Relationships between Bat Coronaviruses and Their Hosts [J]. Emerg Infect Dis. 2007 Oct; 13(10): 1526–1532.
[3] Lai MM, Cavanagh D. The molecular biology of coronaviruses [J]. Adv Virus Res. 1997;48: 1-100.
[4] Jie Cui, Fang Li, Zheng-Li Shi. Origin and evolution of pathogenic coronaviruses [J]. Nat Rev Microbiol. 2019; 17(3): 181–192.
[5] Neuman BW, Kiss G, Kunding AH, et al. A structural analysis of M protein in coronavirus assembly and morphology [J]. J Struct Biol. 2011 Apr; 174(1): 11–22.
[6] Li, Wenhui, Moore, Michael J, et al. Angiotensin-converting enzyme 2 is a functional receptor for the SARS coronavirus [J]. Nature. 2003; 426(6965): 450–454.
[7] Sørensen MD, Sørensen B, Gonzalez-Dosal R, et al. Severe acute respiratory syndrome (SARS): development of diagnostics and antivirals [J]. Ann N Y Acad Sci. 2006 May;1067: 500-5.